Estos archivos ocupan poco espacio en nuestro disco duro porque no almacenan ni videos, ni audios ni fotografías en su interior, solo contiene referencias de donde se encuentran todos los archivos que estamos usando.
Durante el tiempo que dure la edición completa de tu proyecto, intenta guardar todos tus archivos (imágenes, videos y audios) en una misma carpeta, esto vendrá muy bien para no perder nunca ningún archivo ya que si por cualquier causa pierdes un archivo que Premiere esta usando, tendrás que indicarle la nueva ubicación para poder seguir usándolo.
En el peor de los casos, si eliminas completamente un archivo y no tienes una copia, será imposible seguir con la edición a no ser que lo sustituyas por otro diferente.
Por lo tanto apuntase como regla básica, dejar los recursos que vas a usar en tu edición ordenados en una carpeta.